中心以加強基礎、注重能力、引導創新為指導思想，确立了一體化、多層次、開放式的實驗課程體系，以促進學生知識、能力和素質的協調發展。面向一年級學生開設化學實驗平台課；在低年級按化學二級學科設課，完整展現各學科特色；在高年級開設中級實驗課和綜合實驗課，依托學院的學科優勢和學術組的科研資源，将實驗教學與科研訓練有機結合，全面提高學生的創新意識和實踐能力。
2016年，中心配合學校和學院教育教學改革，将原有的8門必修實驗課進一步進行了凝練。新版實驗教學計劃中，僅保留普通化學實驗、有機化學實驗和物理化學實驗作為必修的三門核心實驗課程，其他實驗課程作為專業限選和任選課程，最大限度的為學生提供個性化和多元化學習的空間。
左：原有實驗課程體系 右：2016年改革後的核心課程體系
