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鄒鵬課題組在活細胞核酸标記領域取得新進展



2019726日,beat365beat365、合成與功能生物分子中心鄒鵬課題組《德國應用化學》發表題為“Expanding APEX2 Substrates for Proximity‐Dependent Labeling of Nucleic Acids and Proteins in Living Cells”研究論文,報道了在活細胞中空間特異性标記核酸分子的新技術

真核細胞具有複雜而高度有序的空間結構研究生物大分子的亞細胞定位對于闡明其生物學功能有着重要意義。核酸分子在細胞中特異性分布直接影響基因表達的效率,在蛋白質翻譯調控、學習與記憶形成等一系列生物學過程中扮演了重要角色。針對亞細胞區域中RNA組份研究,傳統手段依賴化學交聯、免疫沉澱、離心分離等技術,不但需要預先破壞細胞的天然結構,而且還局限于少數能夠被機械分離的亞細胞區域,缺乏普适性。

針對這一難題,鄒鵬課題組提出鄰近核酸标記策略策略的核心是在活細胞中利用酶促反應形成大量高活性的自由基,酶鄰近的核酸分子發生共價加成反應從而實現空間特異性标記。從工程改造的過氧化物酶APEX2出發,鄒鵬課題組首先設計合成了十餘生物素偶聯的酶底物,并從中發現生物素-苯胺探針的核酸标記活性最高。他們進一步以線粒體核纖層和核仁等亞細胞結構為例,建立了在活細胞中開展鄰近核酸标記的方法,并通過定量PCR與高通量測序分析證實了标記方法具有良好的空間特異性。鄰近核酸标記技術操作簡單、具有普适性,研究核酸亞細胞定位與功能關系提供了必要工具

beat365beat365博士生周穎、前沿交叉學科研究院博士生王鋼為該論文共同第一作者,鄒鵬研究員為論文通訊作者。該工作得到了國家自然科學基金委、科技部、教育部、北京分子科學國家研究中心和北大-清華生命科學聯合中心的資助。

 

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/anie.201905949

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