近年來,免疫療法在癌症治療中取得了重要進展,但在實體瘤中的療效仍受腫瘤微環境及其内部腫瘤-免疫相互作用的影響。腫瘤微環境的空間異質性對免疫治療的效果至關重要,尤其是直接與腫瘤細胞互作的免疫細胞,在腫瘤進展和清除過程中發揮關鍵作用。然而,現有空間技術如組織成像和空間組學存在通量低、成本高等局限性,難以精準解析細胞相互作用。而細胞-細胞相互作用(CCI)檢測方法通常需要模型抗原呈遞細胞或基因改造的腫瘤細胞,這會破壞原生組織結構并改變細胞相互作用模式。因此,亟需一種能夠在器官/組織原位上分析腫瘤-免疫相互作用的非侵入性平台,在保留原生組織環境的前提下實現細胞互作的高分辨率解析。
針對這一挑戰,陳鵬、樊新元團隊基于生物正交光催化概念,開發了一種深紅光超快光催化鄰近标記技術——CAT-Tissue,實現了組織原位上高分辨率的腫瘤-免疫細胞互作分析。該研究以“Deep-Red and Ultrafast Photocatalytic Proximity Labeling Empowered in situ Dissection of Tumor-Immune Interactions in Primary Tissues”為題,近日發表于《JACS》。CAT-Tissue利用二氫卟酚e6(Ce6)納米抗體偶聯物作為光催化劑,結合生物素-苯胺探針,在活腫瘤組織切片中快速、精準地标記并解析腫瘤-免疫相互作用。結合RNA測序,該技術揭示了腫瘤鄰近與非鄰近CD8+ T細胞之間的顯著基因表達差異,尤其是腫瘤鄰近CD8+ T細胞表現出激活、效應及耗竭表型。憑借深紅光的優異組織穿透性及高生物相容性,CAT-Tissue無需基因改造即可高靈敏度地分析腫瘤-免疫相互作用,為深入理解腫瘤微環境提供了新的技術手段。
圖1.CAT-Tissue技術平台示意圖:基于深紅光超快标記的組織原位解析腫瘤與免疫細胞相互作用。
實驗結果顯示,在腫瘤切片和共培養體系中,CAT-Tissue能夠高效捕獲TCR-pMHC等關鍵免疫相互作用,并精準量化不同親和力TCR-pMHC變體的相互作用強度。此外,該技術在100 μm厚的MC38-hPD-L1腫瘤組織切片中成功标記了腫瘤細胞及其相互作用的CD8+ T細胞、NK細胞和CD4+ T細胞,進一步驗證了其空間選擇性和特異性。
圖2 CAT-Tissue在小鼠腫瘤組織切片中實現鄰近細胞原位标記和空間異質CD8+ T細胞分析。
作者進一步利用轉錄組分析,揭示了腫瘤鄰近CD8+ T細胞相比于遠離腫瘤區域的CD8+ T細胞,在基因表達上存在顯著差異。結果表明,Biotin+ CD8+ T細胞中與細胞毒性、T細胞活化及免疫調控相關的基因顯著上調,而幼稚和記憶T細胞标志基因則顯著下調,進一步揭示了腫瘤微環境對T細胞功能狀态的影響。流式細胞術驗證實驗也進一步支持了這些發現。
總之,CAT-Tissue以其超快動力學、高效标記和卓越的時空分辨率,在保留組織結構的同時,實現了對腫瘤-免疫相互作用的精準分析,為研究腫瘤微環境中的動态免疫過程提供了有力工具。該技術不僅有助于探索腫瘤-免疫系統的相互作用機制,還能為優化免疫治療策略提供重要參考,推動更精準的個體化治療方案。
beat365官方网站的樊新元和陳鵬教授為論文的通訊作者,博士研究生婁之正、博士後張妍為論文的共同第一作者,博士研究生梁軒、曹夢睿、馬毅骢等同學也對該工作有重要貢獻。該研究工作得到了中國科技部、國家自然科學基金委、北京分子科學國家研究中心、北京市科學技術委員會、北京醫院管理中心臨床醫學發展基金等項目資金的支持。
原文鍊接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c17879