王 初

特聘研究員，博士生導師
電子郵件: chuwang#scripps.edu

教育與研究背景

2001年 理學學士 中國科學技術大學生命科學學院分子與細胞生物系
2007年 ，理學博士，美國西雅圖華盛頓大學生物化學系，“生物分子結構與設計”跨學科博士生培養項目
2007年-2009年 ，博士後 ，美國西雅圖華盛頓大學生物化學系，霍華德休斯醫學研究所
2009年-2013年，博士後，美國Scripps研究所化學生理系
2013- 至今，研究員，beat365合成與功能生物分子中心，北大清華生命科學聯合中心
2013- 至今，特聘研究員，博士生導師，beat365官方网站化學生物系,

研究興趣和領域

主要通過化學蛋白質組學,生物化學和計算生物學等多種跨領域的技術和手段，大規模發掘蛋白質組中被内源生物小分子或外源化學藥物分子特異修飾的功能位點和靶點，并深入研究這些修飾對蛋白質的結構、功能以及其所在的細胞内新陳代謝和信号傳導通路的影響。這些研究将有力地推動在後基因組時代人們對大量未知蛋白功能注釋的進程，揭示其在各種新陳代謝通路中的關鍵作用，以及從分子水平上解釋多種病理環境的形成和誘因，為相關的藥物和治療手段的研發提供理論基礎。

目前初步的工作設想包括以下三個方面的内容：
1.運用化學生物學和化學蛋白質組學的技術大規模挖掘在細胞處于氧化應激(oxidative stress)條件下，被内源親電性小分子代謝産物所特異共價修飾的氨基酸功能位點。
2.運用生物化學、細胞生物學以及藥物化學等諸多實驗方法對在細胞氧化應激條件下這些被修飾的位點做深入的功能性研究，以揭示這些修飾對蛋白質結構功能和所在的代謝通路的影響。
3.研發計算結構生物學分子對接(protein-ligand docking)的方法，對小分子配體對蛋白質共價修飾進行結構模拟預測和分子設計，以用于小分子酶抑制劑的開發、藥物設計以及對未知蛋白的功能注釋。

發表論文

1. Wang C^#, Weerapana E, Blewett M, Cravatt BF^#. (2014) A chemoproteomic platform to quantitatively map targets of lipid-derived electrophiles. Nature Methods, 11:79-85.（#并列通訊作者）
2. Dix MM, Simon GM, Wang C, Okerberg E, Patricelli MP, Cravatt BF. (2012) Functional Interplay between Caspase Cleavage and Phosphorylation Sculpts the Apoptotic Proteome. Cell. 2012 150(2):426-40.
3. Martin BR, Wang C, Adibekian A, Tully SE, Cravatt BF. (2011) Global profiling of dynamic protein palmitoylation. Nat Methods. 2011 9(1):84-9.
4. Weerapana E*, Wang C*, Simon GM, Richter F, Khare S, Dillon MB, Bachovchin DA, Mowen K, Baker D, Cravatt BF. (2010). Quantitative reactivity profiling predicts functional cysteines in proteomes. Nature 468:790-5. (*, 并列第一作者)
5. Wang C, Vernon R, Lange O, Tyka M, Baker D. (2010) Prediction of structures of zinc-binding proteins through explicit modeling of metal coordination geometry. Protein Sci 19:494-506.
6. Wang, C.*, Schueler-Furman, O.*, Andre, I., London, N., Fleishman, S. J., Bradley, P., Qian, B. & Baker, D. (2007). RosettaDock in CAPRI rounds 6-12. Proteins 69, 758-63. (*, 并列第一作者)
7. Wang, C., Bradley, P. & Baker, D. (2007). Protein-protein docking with backbone flexibility. J Mol Biol 373, 503-19.
8. Schueler-Furman, O.*, Wang, C.* & Baker, D. (2005). Progress in protein-protein docking: atomic resolution predictions in the CAPRI experiment using RosettaDock with an improved treatment of side-chain flexibility. Proteins 60, 187-94. (*, 并列第一作者)
9. Wang, C.*, Schueler-Furman, O.* & Baker, D. (2005). Improved side-chain modeling for protein-protein docking. Protein Sci 14, 1328-39. (*, 并列第一作者)